牡丹花的根系 发达且肉质,具有多数深根形的肉质主根和侧根。初生根始为白色,渐变为黄色至褐色,肉质白色,个别红色,肉质中心木质化,俗称“木心”。肉质部储有大量养分和水分供植株生长。一般来说,根深的植株枝叶茂盛,植株较高,根浅则枝短株型矮。
牡丹花的根型、数量因品种不同而有所差异,大体上可分为三类:直根型、坡根型和中间型。
此类型的根深,四年生的牡丹根可入土80厘米以上,但根条稀疏,没有明显的主根,仅有几十条粗细均匀的粗“面条根”,根光滑、皮白,根上极少分生小根,根(加工后称“丹皮”)产量高,质量好。如“凤丹”、“赵粉”、“二乔”、“墨魁”等。这类牡丹多为药用兼观赏两用品种。
此类根条粗细长短不一,分生侧根较多,交叉生长,俗称“鸡爪根”,多数入土较浅,斜坡角度大。
此类根条稀密适中,无明显主根,生有多数粗细均称、根皮光滑的“面条根”,平均入土深度在70~80厘米,如“种生黑”、“姚黄”等,既可观赏,又可药用。
此外,观赏牡丹的根系呈四脚八叉状,枝干通常不是笔直的,而凤丹的根系分叉较少,枝干笔直,节点之间的距离较大。药用牡丹的根系发达,根比较粗壮;根可以分为主根和侧根,主根和侧根上密生着根毛。一般移栽后当年就可以形成主根或少数侧根,第二年主根、侧根基本形成,并开始加粗生长。移栽后3-4年,就可以采收了。采收后的根条,还需要去皮,抽去木心,晒干,才可以得到商品药材“牡丹皮”,也就是我们所说的“丹皮”。